Dentre os objetivos e propostas no NAPSaMP temos:

1) Promover a investigação sobre a epidemiologia dos transtornos mentais, visando caracterizar sua distribuição em diferentes populações, identificar fatores etiológicos preveníveis, avaliar o impacto direto e indireto para as pessoas que apresentam esses transtornos, para as que convivem com pessoas afetadas e para a sociedade;

2) Contribuir para a compreensão dos mecanismos biológicos e sociais envolvidos na etiologia desses transtornos, através da articulação de investigações epidemiológicas, em neurociências e em ciências sociais na saúde;

3) Desenvolver e avaliar intervenções complexas efetivas para o tratamento de transtornos mentais, que possam ser incorporadas pelo Sistema Único de Saúde, particularmente ao nível da atenção primária;

4) Formar pesquisadores capacitados para identificar questões de pesquisa relevantes para a população, desenvolver projetos de pesquisa adequados para responder a essas questões, que tenham liderança para coordenar equipes de pesquisa;

5) Integrar a pesquisa nessa área na USP, colaborando com parceiros nacionais e internacionais;

6) Fortalecer o ensino de graduação e de pós-graduação na USP, envolvendo alunos nos projetos coordenados pelos pesquisadores do NAP-SaMP;

7) Informar programas e políticas públicas dirigidas aos cuidados de saúde para pessoas com transtornos mentais e à prevenção desses transtornos;

8) Contribuir para a conscientização da sociedade sobre os transtornos mentais como um problema de saúde pública, visando reduzir o estigma e aumentar o acesso aos cuidados em saúde mental;

9) Criar uma rede nacional e latino-americana de pesquisa em saúde mental populacional, através da promoção de encontros acadêmicos periódicos envolvendo os diversos grupos do país, da AL e de países desenvolvidos envolvidos em colaborações com esses grupos, com finalidades de atualização científica, discussões de resultados e estabelecimento de prioridades e estratégias para investigações colaborativas subsequentes.